Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF8Q02556 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF8Q02556 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms