Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX5Q02548 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX5Q02548 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms