Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSC2Q02487 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms