Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDR2Q01850 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDR2Q01850 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms