Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAP4Q01664 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP4Q01664 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms