Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRCDQ00LT1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms