Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3AP84243 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H3F3AP84243 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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