Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF5P84085 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF5P84085 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF5P84085 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF5P84085 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF5P84085 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF5P84085 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF5P84085 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF5P84085 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF5P84085 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF5P84085 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF5P84085 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF5P84085 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF5P84085 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF5P84085 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF5P84085 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF5P84085 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF5P84085 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF5P84085 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF5P84085 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF5P84085 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF5P84085 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARF5P84085 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARF5P84085 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARF5P84085 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARF5P84085 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF5P84085 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF5P84085 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF5P84085 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF5P84085 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF5P84085 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF5P84085 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF5P84085 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF5P84085 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF5P84085 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF5P84085 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF5P84085 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF5P84085 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF5P84085 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF5P84085 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF5P84085 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF5P84085 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF5P84085 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF5P84085 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF5P84085 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF5P84085 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF5P84085 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF5P84085 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF5P84085 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF5P84085 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF5P84085 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF5P84085 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF5P84085 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF5P84085 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF5P84085 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF5P84085 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF5P84085 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF5P84085 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF5P84085 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF5P84085 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF5P84085 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARF5P84085 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF5P84085 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF5P84085 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms