Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX4P78413 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX4P78413 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX4P78413 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX4P78413 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX4P78413 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX4P78413 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX4P78413 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX4P78413 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRX4P78413 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX4P78413 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX4P78413 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX4P78413 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX4P78413 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX4P78413 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX4P78413 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX4P78413 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX4P78413 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRX4P78413 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX4P78413 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX4P78413 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX4P78413 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX4P78413 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX4P78413 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX4P78413 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX4P78413 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX4P78413 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX4P78413 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX4P78413 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRX4P78413 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRX4P78413 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX4P78413 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX4P78413 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX4P78413 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX4P78413 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX4P78413 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX4P78413 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX4P78413 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX4P78413 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX4P78413 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX4P78413 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRX4P78413 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX4P78413 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX4P78413 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX4P78413 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX4P78413 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX4P78413 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX4P78413 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX4P78413 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX4P78413 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX4P78413 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRX4P78413 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX4P78413 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX4P78413 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX4P78413 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX4P78413 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRX4P78413 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX4P78413 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX4P78413 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX4P78413 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX4P78413 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX4P78413 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX4P78413 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX4P78413 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX4P78413 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX4P78413 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX4P78413 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX4P78413 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX4P78413 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX4P78413 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX4P78413 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX4P78413 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms