Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT83P78385 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT83P78385 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT83P78385 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT83P78385 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT83P78385 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT83P78385 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT83P78385 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT83P78385 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT83P78385 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT83P78385 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT83P78385 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT83P78385 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT83P78385 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT83P78385 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT83P78385 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT83P78385 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT83P78385 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT83P78385 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT83P78385 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT83P78385 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT83P78385 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT83P78385 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT83P78385 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT83P78385 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT83P78385 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT83P78385 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT83P78385 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT83P78385 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT83P78385 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT83P78385 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT83P78385 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT83P78385 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT83P78385 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT83P78385 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT83P78385 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT83P78385 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT83P78385 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT83P78385 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT83P78385 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT83P78385 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT83P78385 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT83P78385 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT83P78385 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT83P78385 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT83P78385 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT83P78385 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT83P78385 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT83P78385 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT83P78385 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT83P78385 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT83P78385 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT83P78385 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT83P78385 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT83P78385 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT83P78385 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT83P78385 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT83P78385 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT83P78385 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT83P78385 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT83P78385 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT83P78385 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT83P78385 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT83P78385 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT83P78385 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT83P78385 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT83P78385 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms