Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms