Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNC1P63316 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms