Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO1P63165 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms