Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTA2P62736 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTA2P62736 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms