Protein–RNA interactions for Protein: P62714

PPP2CB, Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2CBP62714 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP2CBP62714 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP2CBP62714 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2CBP62714 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2CBP62714 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2CBP62714 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2CBP62714 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2CBP62714 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2CBP62714 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2CBP62714 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2CBP62714 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2CBP62714 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2CBP62714 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP2CBP62714 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms