Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS29P62273 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS29P62273 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS29P62273 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RPS29P62273 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPS29P62273 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPS29P62273 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RPS29P62273 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms