Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms