Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTENP60484 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTENP60484 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PTENP60484 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTENP60484 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTENP60484 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTENP60484 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTENP60484 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTENP60484 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTENP60484 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTENP60484 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTENP60484 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTENP60484 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTENP60484 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTENP60484 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTENP60484 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTENP60484 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTENP60484 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTENP60484 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTENP60484 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTENP60484 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTENP60484 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTENP60484 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTENP60484 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTENP60484 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTENP60484 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTENP60484 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTENP60484 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTENP60484 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTENP60484 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTENP60484 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTENP60484 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTENP60484 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTENP60484 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTENP60484 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTENP60484 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTENP60484 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTENP60484 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTENP60484 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTENP60484 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTENP60484 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTENP60484 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTENP60484 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTENP60484 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTENP60484 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTENP60484 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTENP60484 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTENP60484 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTENP60484 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTENP60484 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTENP60484 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTENP60484 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTENP60484 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTENP60484 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTENP60484 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTENP60484 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTENP60484 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTENP60484 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTENP60484 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTENP60484 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTENP60484 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTENP60484 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTENP60484 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTENP60484 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTENP60484 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTENP60484 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTENP60484 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTENP60484 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTENP60484 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTENP60484 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTENP60484 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTENP60484 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTENP60484 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTENP60484 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTENP60484 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTENP60484 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTENP60484 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTENP60484 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms