Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX16P57768 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX16P57768 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX16P57768 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX16P57768 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX16P57768 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX16P57768 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX16P57768 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX16P57768 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX16P57768 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX16P57768 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX16P57768 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX16P57768 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX16P57768 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX16P57768 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX16P57768 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX16P57768 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX16P57768 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX16P57768 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX16P57768 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX16P57768 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX16P57768 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX16P57768 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX16P57768 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX16P57768 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX16P57768 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX16P57768 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX16P57768 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX16P57768 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX16P57768 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX16P57768 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX16P57768 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX16P57768 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX16P57768 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX16P57768 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX16P57768 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX16P57768 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX16P57768 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX16P57768 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX16P57768 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX16P57768 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX16P57768 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX16P57768 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX16P57768 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX16P57768 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX16P57768 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX16P57768 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX16P57768 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX16P57768 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX16P57768 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX16P57768 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX16P57768 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX16P57768 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX16P57768 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX16P57768 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX16P57768 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX16P57768 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX16P57768 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX16P57768 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX16P57768 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX16P57768 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX16P57768 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX16P57768 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX16P57768 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX16P57768 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX16P57768 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX16P57768 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX16P57768 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX16P57768 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX16P57768 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX16P57768 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX16P57768 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX16P57768 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX16P57768 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX16P57768 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX16P57768 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX16P57768 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX16P57768 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX16P57768 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX16P57768 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX16P57768 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms