Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSDMDP57764 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms