Protein–RNA interactions for Protein: P57076

C21orf59, UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59P57076 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C21orf59P57076 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C21orf59P57076 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms