Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BACE1P56817 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BACE1P56817 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BACE1P56817 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BACE1P56817 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BACE1P56817 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BACE1P56817 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BACE1P56817 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BACE1P56817 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BACE1P56817 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BACE1P56817 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BACE1P56817 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BACE1P56817 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BACE1P56817 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BACE1P56817 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BACE1P56817 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BACE1P56817 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BACE1P56817 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BACE1P56817 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BACE1P56817 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BACE1P56817 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BACE1P56817 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BACE1P56817 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BACE1P56817 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BACE1P56817 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BACE1P56817 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BACE1P56817 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BACE1P56817 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BACE1P56817 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BACE1P56817 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BACE1P56817 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BACE1P56817 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BACE1P56817 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BACE1P56817 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BACE1P56817 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BACE1P56817 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BACE1P56817 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BACE1P56817 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BACE1P56817 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BACE1P56817 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms