Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFRA1P56159 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms