Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP9P55211 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP9P55211 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP9P55211 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP9P55211 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP9P55211 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP9P55211 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP9P55211 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP9P55211 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP9P55211 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP9P55211 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP9P55211 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP9P55211 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP9P55211 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP9P55211 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP9P55211 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP9P55211 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP9P55211 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP9P55211 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP9P55211 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP9P55211 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP9P55211 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP9P55211 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP9P55211 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP9P55211 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP9P55211 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP9P55211 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP9P55211 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP9P55211 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP9P55211 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP9P55211 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP9P55211 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP9P55211 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP9P55211 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP9P55211 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP9P55211 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP9P55211 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP9P55211 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP9P55211 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP9P55211 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP9P55211 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP9P55211 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP9P55211 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms