Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HADHBP55084 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HADHBP55084 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HADHBP55084 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HADHBP55084 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HADHBP55084 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HADHBP55084 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HADHBP55084 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HADHBP55084 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HADHBP55084 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HADHBP55084 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HADHBP55084 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HADHBP55084 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HADHBP55084 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HADHBP55084 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HADHBP55084 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HADHBP55084 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HADHBP55084 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HADHBP55084 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHBP55084 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHBP55084 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHBP55084 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHBP55084 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHBP55084 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHBP55084 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHBP55084 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHBP55084 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HADHBP55084 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HADHBP55084 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HADHBP55084 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HADHBP55084 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HADHBP55084 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HADHBP55084 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HADHBP55084 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HADHBP55084 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HADHBP55084 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HADHBP55084 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HADHBP55084 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HADHBP55084 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHBP55084 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHBP55084 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHBP55084 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHBP55084 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHBP55084 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHBP55084 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHBP55084 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHBP55084 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHBP55084 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHBP55084 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHBP55084 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHBP55084 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHBP55084 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHBP55084 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHBP55084 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHBP55084 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHBP55084 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHBP55084 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHBP55084 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHBP55084 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHBP55084 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHBP55084 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHBP55084 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHBP55084 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHBP55084 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHBP55084 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHBP55084 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHBP55084 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHBP55084 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHBP55084 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHBP55084 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHBP55084 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHBP55084 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms