Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC4P55056 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC4P55056 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC4P55056 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4P55056 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4P55056 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOC4P55056 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4P55056 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4P55056 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4P55056 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4P55056 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4P55056 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4P55056 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4P55056 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4P55056 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4P55056 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4P55056 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1189.1 ms