Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB1P54762 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB1P54762 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms