Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA8P53708 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA8P53708 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms