Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIMK2P53671 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms