Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms