Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AFF1P51825 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF1P51825 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF1P51825 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF1P51825 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF1P51825 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF1P51825 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF1P51825 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF1P51825 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF1P51825 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF1P51825 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF1P51825 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF1P51825 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF1P51825 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF1P51825 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF1P51825 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF1P51825 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF1P51825 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF1P51825 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF1P51825 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF1P51825 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF1P51825 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF1P51825 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF1P51825 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF1P51825 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF1P51825 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF1P51825 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF1P51825 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF1P51825 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF1P51825 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF1P51825 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF1P51825 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF1P51825 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF1P51825 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF1P51825 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF1P51825 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF1P51825 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF1P51825 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF1P51825 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF1P51825 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF1P51825 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF1P51825 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF1P51825 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF1P51825 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF1P51825 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF1P51825 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF1P51825 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF1P51825 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF1P51825 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF1P51825 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF1P51825 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF1P51825 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF1P51825 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF1P51825 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF1P51825 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF1P51825 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF1P51825 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF1P51825 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF1P51825 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF1P51825 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF1P51825 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF1P51825 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF1P51825 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF1P51825 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF1P51825 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF1P51825 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF1P51825 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF1P51825 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF1P51825 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF1P51825 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF1P51825 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF1P51825 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF1P51825 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF1P51825 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF1P51825 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF1P51825 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms