Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR8P51685 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR8P51685 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR8P51685 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR8P51685 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR8P51685 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR8P51685 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR8P51685 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR8P51685 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR8P51685 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR8P51685 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR8P51685 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR8P51685 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR8P51685 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR8P51685 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR8P51685 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR8P51685 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR8P51685 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR8P51685 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR8P51685 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR8P51685 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR8P51685 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR8P51685 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR8P51685 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR8P51685 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR8P51685 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR8P51685 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR8P51685 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR8P51685 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR8P51685 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR8P51685 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR8P51685 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR8P51685 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR8P51685 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR8P51685 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR8P51685 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR8P51685 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR8P51685 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR8P51685 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCR8P51685 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR8P51685 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR8P51685 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR8P51685 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR8P51685 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR8P51685 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR8P51685 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR8P51685 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR8P51685 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR8P51685 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR8P51685 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR8P51685 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR8P51685 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms