Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
SMARCA2P51531 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
SMARCA2P51531 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms