Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms