Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCAMP50895 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCAMP50895 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCAMP50895 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCAMP50895 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCAMP50895 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCAMP50895 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCAMP50895 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCAMP50895 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAMP50895 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAMP50895 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAMP50895 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAMP50895 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAMP50895 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAMP50895 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAMP50895 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAMP50895 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAMP50895 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAMP50895 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAMP50895 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAMP50895 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAMP50895 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAMP50895 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAMP50895 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAMP50895 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAMP50895 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAMP50895 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAMP50895 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAMP50895 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAMP50895 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAMP50895 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAMP50895 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAMP50895 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAMP50895 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAMP50895 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAMP50895 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCAMP50895 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
BCAMP50895 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCAMP50895 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCAMP50895 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCAMP50895 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCAMP50895 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCAMP50895 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCAMP50895 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCAMP50895 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCAMP50895 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BCAMP50895 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCAMP50895 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCAMP50895 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAMP50895 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAMP50895 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAMP50895 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAMP50895 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAMP50895 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAMP50895 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAMP50895 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAMP50895 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAMP50895 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAMP50895 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAMP50895 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAMP50895 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAMP50895 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAMP50895 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAMP50895 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAMP50895 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAMP50895 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAMP50895 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAMP50895 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAMP50895 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAMP50895 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAMP50895 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAMP50895 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAMP50895 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAMP50895 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAMP50895 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAMP50895 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCAMP50895 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCAMP50895 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAMP50895 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAMP50895 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAMP50895 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAMP50895 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAMP50895 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAMP50895 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAMP50895 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAMP50895 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAMP50895 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAMP50895 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAMP50895 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAMP50895 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAMP50895 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCAMP50895 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCAMP50895 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCAMP50895 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCAMP50895 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCAMP50895 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCAMP50895 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCAMP50895 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCAMP50895 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCAMP50895 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms