Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX5P50542 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX5P50542 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX5P50542 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX5P50542 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX5P50542 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX5P50542 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX5P50542 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX5P50542 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX5P50542 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX5P50542 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX5P50542 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX5P50542 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX5P50542 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX5P50542 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX5P50542 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX5P50542 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX5P50542 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX5P50542 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX5P50542 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX5P50542 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX5P50542 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX5P50542 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX5P50542 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX5P50542 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX5P50542 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX5P50542 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX5P50542 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX5P50542 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX5P50542 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX5P50542 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX5P50542 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX5P50542 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX5P50542 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX5P50542 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX5P50542 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX5P50542 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX5P50542 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX5P50542 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX5P50542 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX5P50542 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX5P50542 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX5P50542 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX5P50542 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX5P50542 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX5P50542 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX5P50542 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX5P50542 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX5P50542 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX5P50542 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX5P50542 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX5P50542 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX5P50542 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PEX5P50542 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX5P50542 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX5P50542 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX5P50542 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX5P50542 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX5P50542 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX5P50542 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX5P50542 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX5P50542 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX5P50542 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX5P50542 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX5P50542 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX5P50542 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX5P50542 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX5P50542 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX5P50542 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX5P50542 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX5P50542 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX5P50542 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX5P50542 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX5P50542 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX5P50542 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms