Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATMP50440 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATMP50440 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATMP50440 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATMP50440 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATMP50440 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GATMP50440 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GATMP50440 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATMP50440 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATMP50440 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATMP50440 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATMP50440 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATMP50440 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATMP50440 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATMP50440 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATMP50440 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATMP50440 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATMP50440 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATMP50440 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATMP50440 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATMP50440 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATMP50440 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATMP50440 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATMP50440 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATMP50440 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATMP50440 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATMP50440 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATMP50440 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATMP50440 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATMP50440 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATMP50440 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATMP50440 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATMP50440 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATMP50440 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GATMP50440 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATMP50440 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATMP50440 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATMP50440 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATMP50440 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATMP50440 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATMP50440 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATMP50440 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATMP50440 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms