Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VEGFBP49765 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VEGFBP49765 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms