Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLK1P49759 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLK1P49759 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLK1P49759 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLK1P49759 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLK1P49759 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLK1P49759 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLK1P49759 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLK1P49759 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLK1P49759 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLK1P49759 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLK1P49759 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLK1P49759 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLK1P49759 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLK1P49759 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLK1P49759 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLK1P49759 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLK1P49759 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLK1P49759 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLK1P49759 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLK1P49759 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLK1P49759 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLK1P49759 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLK1P49759 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLK1P49759 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLK1P49759 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLK1P49759 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLK1P49759 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLK1P49759 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLK1P49759 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLK1P49759 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLK1P49759 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLK1P49759 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLK1P49759 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLK1P49759 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLK1P49759 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLK1P49759 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLK1P49759 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLK1P49759 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLK1P49759 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLK1P49759 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLK1P49759 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLK1P49759 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLK1P49759 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLK1P49759 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLK1P49759 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLK1P49759 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLK1P49759 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLK1P49759 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLK1P49759 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLK1P49759 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CLK1P49759 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLK1P49759 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLK1P49759 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLK1P49759 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLK1P49759 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLK1P49759 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLK1P49759 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLK1P49759 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLK1P49759 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLK1P49759 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLK1P49759 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLK1P49759 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLK1P49759 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLK1P49759 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLK1P49759 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms