Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSNK1EP49674 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK1EP49674 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms