Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA1P49639 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA1P49639 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms