Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPAP49450 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPAP49450 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPAP49450 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPAP49450 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPAP49450 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPAP49450 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPAP49450 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPAP49450 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPAP49450 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPAP49450 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPAP49450 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPAP49450 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPAP49450 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPAP49450 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPAP49450 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPAP49450 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPAP49450 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPAP49450 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPAP49450 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPAP49450 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPAP49450 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPAP49450 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPAP49450 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPAP49450 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPAP49450 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPAP49450 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPAP49450 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPAP49450 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPAP49450 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPAP49450 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPAP49450 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPAP49450 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPAP49450 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPAP49450 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPAP49450 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPAP49450 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPAP49450 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms