Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AMPHP49418 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
AMPHP49418 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
AMPHP49418 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AMPHP49418 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
AMPHP49418 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
AMPHP49418 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
AMPHP49418 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
AMPHP49418 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
AMPHP49418 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
AMPHP49418 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
AMPHP49418 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AMPHP49418 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
AMPHP49418 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
AMPHP49418 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AMPHP49418 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
AMPHP49418 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
AMPHP49418 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AMPHP49418 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AMPHP49418 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AMPHP49418 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
AMPHP49418 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
AMPHP49418 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AMPHP49418 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AMPHP49418 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
AMPHP49418 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
AMPHP49418 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
AMPHP49418 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
AMPHP49418 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AMPHP49418 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AMPHP49418 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AMPHP49418 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
AMPHP49418 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
AMPHP49418 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
AMPHP49418 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
AMPHP49418 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
AMPHP49418 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
AMPHP49418 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
AMPHP49418 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
AMPHP49418 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
AMPHP49418 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
AMPHP49418 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
AMPHP49418 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AMPHP49418 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
AMPHP49418 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
AMPHP49418 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
AMPHP49418 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
AMPHP49418 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
AMPHP49418 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
AMPHP49418 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
AMPHP49418 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
AMPHP49418 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
AMPHP49418 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
AMPHP49418 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
AMPHP49418 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
AMPHP49418 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
AMPHP49418 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
AMPHP49418 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
AMPHP49418 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
AMPHP49418 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
AMPHP49418 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
AMPHP49418 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
AMPHP49418 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
AMPHP49418 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
AMPHP49418 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
AMPHP49418 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
AMPHP49418 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
AMPHP49418 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
AMPHP49418 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
AMPHP49418 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
AMPHP49418 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
AMPHP49418 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
AMPHP49418 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
AMPHP49418 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
AMPHP49418 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
AMPHP49418 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
AMPHP49418 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
AMPHP49418 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
AMPHP49418 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
AMPHP49418 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
AMPHP49418 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
AMPHP49418 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
AMPHP49418 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
AMPHP49418 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
AMPHP49418 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
AMPHP49418 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
AMPHP49418 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
AMPHP49418 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
AMPHP49418 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms