Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD2P49005 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD2P49005 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD2P49005 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD2P49005 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD2P49005 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD2P49005 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD2P49005 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD2P49005 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD2P49005 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD2P49005 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD2P49005 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD2P49005 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD2P49005 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD2P49005 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD2P49005 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD2P49005 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD2P49005 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD2P49005 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD2P49005 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD2P49005 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD2P49005 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD2P49005 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD2P49005 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD2P49005 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD2P49005 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD2P49005 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD2P49005 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD2P49005 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD2P49005 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD2P49005 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD2P49005 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD2P49005 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLD2P49005 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLD2P49005 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD2P49005 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD2P49005 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD2P49005 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD2P49005 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD2P49005 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD2P49005 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD2P49005 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD2P49005 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD2P49005 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD2P49005 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD2P49005 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD2P49005 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD2P49005 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD2P49005 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD2P49005 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD2P49005 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD2P49005 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD2P49005 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD2P49005 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD2P49005 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD2P49005 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD2P49005 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD2P49005 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD2P49005 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD2P49005 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms