Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KRT6CP48668 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT6CP48668 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms