Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLMP48507 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLMP48507 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCLMP48507 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLMP48507 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLMP48507 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLMP48507 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLMP48507 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLMP48507 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLMP48507 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLMP48507 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLMP48507 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLMP48507 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCLMP48507 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLMP48507 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLMP48507 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLMP48507 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLMP48507 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLMP48507 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLMP48507 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLMP48507 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCLMP48507 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCLMP48507 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLMP48507 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLMP48507 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLMP48507 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLMP48507 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLMP48507 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCLMP48507 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLMP48507 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLMP48507 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLMP48507 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLMP48507 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLMP48507 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCLMP48507 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCLMP48507 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLMP48507 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLMP48507 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLMP48507 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLMP48507 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLMP48507 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCLMP48507 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLMP48507 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLMP48507 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLMP48507 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLMP48507 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLMP48507 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLMP48507 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLMP48507 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLMP48507 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLMP48507 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLMP48507 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLMP48507 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLMP48507 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLMP48507 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLMP48507 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLMP48507 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLMP48507 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLMP48507 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLMP48507 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLMP48507 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLMP48507 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLMP48507 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLMP48507 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLMP48507 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLMP48507 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLMP48507 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLMP48507 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLMP48507 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLMP48507 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLMP48507 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLMP48507 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLMP48507 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms