Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRA4P48169 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms