Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XCR1P46094 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XCR1P46094 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XCR1P46094 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XCR1P46094 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XCR1P46094 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XCR1P46094 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XCR1P46094 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XCR1P46094 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XCR1P46094 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XCR1P46094 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCR1P46094 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XCR1P46094 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XCR1P46094 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XCR1P46094 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XCR1P46094 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XCR1P46094 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XCR1P46094 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XCR1P46094 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XCR1P46094 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XCR1P46094 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XCR1P46094 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XCR1P46094 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XCR1P46094 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XCR1P46094 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XCR1P46094 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XCR1P46094 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XCR1P46094 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XCR1P46094 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XCR1P46094 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XCR1P46094 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XCR1P46094 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XCR1P46094 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XCR1P46094 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XCR1P46094 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XCR1P46094 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XCR1P46094 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XCR1P46094 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XCR1P46094 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XCR1P46094 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XCR1P46094 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XCR1P46094 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XCR1P46094 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XCR1P46094 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XCR1P46094 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XCR1P46094 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XCR1P46094 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XCR1P46094 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XCR1P46094 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XCR1P46094 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XCR1P46094 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XCR1P46094 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XCR1P46094 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XCR1P46094 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XCR1P46094 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XCR1P46094 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XCR1P46094 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XCR1P46094 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XCR1P46094 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XCR1P46094 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XCR1P46094 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XCR1P46094 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XCR1P46094 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XCR1P46094 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XCR1P46094 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XCR1P46094 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XCR1P46094 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XCR1P46094 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XCR1P46094 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XCR1P46094 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XCR1P46094 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XCR1P46094 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XCR1P46094 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XCR1P46094 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XCR1P46094 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XCR1P46094 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XCR1P46094 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XCR1P46094 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XCR1P46094 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XCR1P46094 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XCR1P46094 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XCR1P46094 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms