Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A1P43005 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A1P43005 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms