Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms